32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4188 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  92.31 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  46.2 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  46.2 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  46.2 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  46.2 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  37.66 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  45.65 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  39.19 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  39.19 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  38.74 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  36.91 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  35.2 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  34.69 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  34.69 
 
 		 204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  34.18 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  24.66 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  22.82 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1784  hypothetical protein  23.83 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.853239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1885  hypothetical protein  21.88 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1292  hypothetical protein  25.34 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7534  hypothetical protein  34.67 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  35.48 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2632  hypothetical protein  25.47 
 
 		 280 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.505342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>