28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0738 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  97.87 
 
 
235 aa  483  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  97.87 
 
 
235 aa  483  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  98.3 
 
 
235 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  62.13 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  62.13 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  62.13 
 
 
231 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  61.7 
 
 
231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  60.43 
 
 
235 aa  296  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  60 
 
 
235 aa  296  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.622505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  60 
 
 
235 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  60 
 
 
235 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  58.72 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  58.72 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  58.72 
 
 
235 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  59.8 
 
 
204 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  59.31 
 
 
204 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  59.31 
 
 
204 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  58.82 
 
 
204 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  46.2 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  43.48 
 
 
234 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  38.96 
 
 
231 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  22.7 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  59.46 
 
 
37 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1291  hypothetical protein  25 
 
 
573 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.836535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  23.26 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  23.95 
 
 
286 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>