11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2063 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01731  predicted inner membrane protein  25.52 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000484302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1880  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00182412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1846  hypothetical protein  25.52 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000163018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1870  hypothetical protein  25.52 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01719  hypothetical protein  25.52 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000724895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2482  hypothetical protein  25.52 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0976568  normal  0.614179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1985  hypothetical protein  26.84 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1885  hypothetical protein  26.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1784  hypothetical protein  23.4 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.853239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  21.43 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>