173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5586 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5583  transposase IS3/IS911  100 
 
 
65 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14816  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5586  transposase IS3/IS911  100 
 
 
65 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  55.93 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  55.93 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  55.93 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  55.93 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  52.54 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0571  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1092  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1591  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2032  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3564  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  51.72 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  50.85 
 
 
108 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  48.33 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  49.15 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  49.15 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  54.9 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  52.94 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  52.94 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  49.18 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  52.94 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  52.94 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  52.94 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  43.55 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  45.31 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  45.31 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  45.45 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  43.33 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  42.59 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  42.59 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  45.28 
 
 
492 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  38.46 
 
 
114 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 
114 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 
114 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 
114 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  39.06 
 
 
127 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 
127 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  40.74 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  40.74 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  38.18 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>