More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3564 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2032  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  207  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0571  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 103 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1092  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 103 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1591  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 103 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3564  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 103 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4636  transposase IS3/IS911 family protein  82.8 
 
 		 101 aa  157  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4647  putative transposase  85.88 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  47.57 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  47.57 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  53.54 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  48.48 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  49.49 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  49.49 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  48.48 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  48.45 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  48.45 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  46 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  47.47 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  48.48 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  48.48 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  46.46 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  47.96 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  43.3 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  41.58 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  43 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  43 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  39.6 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  39.6 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13980  Transposase  40.59 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  39 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  37.76 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  48.81 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  40.38 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  40.38 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  40.38 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  40.38 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  40.23 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  42.86 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>