More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1239 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  97.98 
 
 		 108 aa  192  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  97.98 
 
 		 108 aa  192  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  97.98 
 
 		 108 aa  192  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  97.5 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  74.75 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2587  hypothetical protein  97.37 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000140598  hitchhiker  0.000388749 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  67.59 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  67.59 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  69.7 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  69.23 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  69.23 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  78.75 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  63.04 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  55.75 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  55.75 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  55.32 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0742  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4236  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1894  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4081  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4623  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1403  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0381  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  47 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  47 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  49.47 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  45 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  47.57 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  50.54 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  50.54 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  50.54 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  45.63 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0739  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  47.37 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  46.46 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  46.46 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  43.69 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  49 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  49 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  49 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  49 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  49 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  49 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  45.92 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  50 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  40 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  48.94 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>