37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0453 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0453  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  28.91 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  25.19 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  25.41 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  27.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  23.72 
 
 
240 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  27.73 
 
 
551 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  26.56 
 
 
250 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  24.57 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  26.89 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  26.05 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  26.05 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  26.05 
 
 
241 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  26.05 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  26.05 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  30.82 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  26.05 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  27.83 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  25.21 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  29.79 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  31.91 
 
 
233 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  29.75 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  29.46 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  29.66 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  29.66 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  29.66 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  30.09 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  30.09 
 
 
211 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  26.64 
 
 
233 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  28.95 
 
 
229 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  28.95 
 
 
229 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>