20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1340 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1340  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 243 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0581505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0039  anti sigma-E protein, RseA  38.75 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3059  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  30.77 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185933  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2465  anti sigma-E protein RseA-like  42.47 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1096  anti sigma-E protein, RseA  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.076128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02430  hypothetical protein  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2727  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2858  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02466  anti-sigma factor  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1105  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2725  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2937  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.339714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3809  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  29.91 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0371131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2626  anti sigma-E protein, RseA  44.74 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3605  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.61 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1183  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.61 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.013522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1130  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.61 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0835394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3675  anti-RNA polymerase sigma factor SigE  33.58 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.454383  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002492  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseA  30.4 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0123192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01712  regulatory protein  42.86 
 
 		 296 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>