20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4302 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  98.28 
 
 
742 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4582  abortive infection protein  61.04 
 
 
236 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2123  abortive infection protein  60.61 
 
 
236 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.173741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11163  hypothetical protein  53.94 
 
 
282 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5144  Abortive infection protein  50.95 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  43.32 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1970  Abortive infection protein  44.7 
 
 
254 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277933  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01050  CAAX amino terminal protease family  44.19 
 
 
244 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4566  abortive infection protein  48.17 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  29.86 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  29.86 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  24.04 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  24.04 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  31.13 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4289  Abortive infection protein  35.34 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  34.44 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>