15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5144 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5144  Abortive infection protein  100 
 
 
239 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1970  Abortive infection protein  53.67 
 
 
254 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4582  abortive infection protein  47.91 
 
 
236 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2123  abortive infection protein  47.42 
 
 
236 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.173741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  47.96 
 
 
234 aa  197  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4566  abortive infection protein  54.55 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01050  CAAX amino terminal protease family  53.25 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11163  hypothetical protein  52.58 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  50.25 
 
 
253 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  50.25 
 
 
253 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  45.45 
 
 
742 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  33.81 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  33.81 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4289  Abortive infection protein  30 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  29.61 
 
 
180 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>