18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1970 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1970  Abortive infection protein  100 
 
 		 254 aa  492  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5144  Abortive infection protein  53.67 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  41.88 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01050  CAAX amino terminal protease family  50.88 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2123  abortive infection protein  43.93 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.173741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4582  abortive infection protein  43.06 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4566  abortive infection protein  49.55 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  40.65 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  40.65 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11163  hypothetical protein  43.46 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  45.4 
 
 		 742 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4289  Abortive infection protein  34.45 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1521  abortive infection protein  38.14 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  24.44 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  24.44 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>