21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4135 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2123  abortive infection protein  50.46 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.173741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4582  abortive infection protein  49.53 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11163  hypothetical protein  54.68 
 
 		 282 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5144  Abortive infection protein  47.96 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1970  Abortive infection protein  41.88 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  42.57 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  42.57 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4566  abortive infection protein  48.83 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01050  CAAX amino terminal protease family  42.27 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  41.3 
 
 		 742 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4289  Abortive infection protein  29.78 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  25 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  25 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  28.1 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  28.89 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  28.68 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 288 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>