15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4566 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4566  abortive infection protein  100 
 
 
233 aa  447  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5144  Abortive infection protein  54.55 
 
 
239 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01050  CAAX amino terminal protease family  52.27 
 
 
244 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1970  Abortive infection protein  49.55 
 
 
254 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4582  abortive infection protein  46.61 
 
 
236 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4135  Abortive infection protein  47.14 
 
 
234 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2123  abortive infection protein  47.14 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.173741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11163  hypothetical protein  51.5 
 
 
282 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4148  abortive infection protein  49.03 
 
 
253 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4302  abortive infection protein  49.03 
 
 
253 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0842577  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4072  abortive infection protein  44.39 
 
 
742 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4289  Abortive infection protein  30.65 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  28.57 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  35.4 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  28.57 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>