14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1709 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1709  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  270  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0812  hypothetical protein  38.24 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.398815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1417  hypothetical protein  42.06 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1059  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  60.34 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1362  hypothetical protein  35.65 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000000143479  decreased coverage  0.00000000311622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1099  hypothetical protein  43.18 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  36.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0802  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  43.59 
 
 
244 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2246  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3726  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  44.44 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1977  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  44.44 
 
 
256 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1207  hypothetical protein  42.11 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1131  hypothetical protein  32.26 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2035  hypothetical protein  56.25 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>