15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2246 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2246  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0802  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  39.84 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1977  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  39.53 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3726  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  41.04 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1099  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  34.44 
 
 
158 aa  55.1  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1133  hypothetical protein  54.55 
 
 
112 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1542  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1207  hypothetical protein  42.22 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0818  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.477008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1139  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1709  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1453  hypothetical protein  38.6 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1362  hypothetical protein  29.11 
 
 
116 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000000143479  decreased coverage  0.00000000311622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1131  hypothetical protein  42.42 
 
 
108 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>