11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1542 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  219  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0818  hypothetical protein  84.82 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.477008  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1133  hypothetical protein  86.61 
 
 		 112 aa  188  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1139  hypothetical protein  57.66 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1131  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3726  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  51.52 
 
 		 264 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2246  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1977  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  41.03 
 
 		 256 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0802  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  58.06 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1099  hypothetical protein  54.84 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  42.5 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>