13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3726 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3726  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1977  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  51.08 
 
 
256 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0802  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  39.35 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2246  hypothetical protein  39.84 
 
 
210 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1099  hypothetical protein  35.86 
 
 
220 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1542  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0818  hypothetical protein  51.52 
 
 
112 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.477008  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1133  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1207  hypothetical protein  24.7 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  44.74 
 
 
158 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1139  hypothetical protein  51.61 
 
 
111 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1709  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1417  hypothetical protein  45 
 
 
127 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>