11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0818 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0818  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  222  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.477008  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1542  hypothetical protein  84.82 
 
 
112 aa  191  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1133  hypothetical protein  83.04 
 
 
112 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1139  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1131  hypothetical protein  43.64 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2246  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3726  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  51.52 
 
 
264 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1099  hypothetical protein  31.33 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1977  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  48.48 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0802  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  56.25 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  40.43 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>