12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2035 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2035  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1842  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  56.88 
 
 
118 aa  142  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0650  hypothetical protein  51.47 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000000546146  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1652  hypothetical protein  34.26 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.939186  normal  0.0110267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0599  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0679  hypothetical protein  31.9 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1659  hypothetical protein  53.49 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0345305  hitchhiker  0.000764264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1991  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.910082  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  40.48 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1207  hypothetical protein  45.65 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0621  hypothetical protein  51.22 
 
 
109 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1709  hypothetical protein  56.25 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>