11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1842 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1842  Sjogrens syndrome scleroderma autoantigen 1  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2035  hypothetical protein  56.88 
 
 
119 aa  131  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0650  hypothetical protein  48.48 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000000546146  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0599  hypothetical protein  35.29 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1991  hypothetical protein  32.14 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.910082  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0679  hypothetical protein  32.74 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1652  hypothetical protein  30.97 
 
 
119 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.939186  normal  0.0110267 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1659  hypothetical protein  47.73 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0345305  hitchhiker  0.000764264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0921  hypothetical protein  38.64 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0621  hypothetical protein  51.22 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1207  hypothetical protein  41.3 
 
 
226 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>