93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4224 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  100 
 
 		 307 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  99.67 
 
 		 307 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  98.05 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  76.22 
 
 		 304 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  75.24 
 
 		 304 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  75.9 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  51.96 
 
 		 299 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  50.99 
 
 		 294 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  49.35 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  52.13 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  47.37 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  45.42 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  47.37 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  35.62 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  35.64 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  35.64 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  35.64 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  35.64 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  35.64 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  35.27 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  33.2 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  31.16 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  32.57 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  30.45 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  32.55 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  31.43 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  31.86 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  29.92 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  28.57 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  28.07 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  29 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  28.88 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  29.25 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  29.91 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  27.73 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  25.61 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  26.05 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  27.7 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  26.76 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  26.76 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  25.91 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  25.55 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  29.77 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  26.85 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  25.85 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  28.27 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  26.46 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  29.25 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  28.64 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  27.24 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  27.24 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  27.24 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  27.24 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  27.24 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  26.26 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  27.23 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  28.57 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  25.72 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  25.72 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  25.77 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  25.81 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  25.72 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  26.48 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  27.71 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  25.77 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  27.78 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  25.77 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  27.19 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  27.42 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  26.7 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  26.87 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  28.08 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  28.95 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  25.98 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  27.51 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  26.01 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  26.63 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  26.84 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  26.7 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  26.18 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  25 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  24.62 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  25.12 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  24.32 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  25.41 
 
 		 188 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  24.73 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  25.95 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  23.68 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  22.22 
 
 		 203 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  24.75 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  22.78 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  23.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  24.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>