108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0221 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  53.15 
 
 		 292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  52.22 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  50 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  52.5 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  54.25 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  48.77 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  46.88 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  41.78 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  41.92 
 
 		 290 aa  224  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  45.05 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  42.38 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  41.03 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  42.8 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  40.94 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  41.52 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  41.16 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  41.16 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  40.67 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  38.85 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  39.36 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  38.29 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  39.08 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  36.16 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  36.16 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  35.71 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  35.71 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  35.71 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  36.61 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  36.16 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  38.86 
 
 		 421 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  37.88 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  37.31 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  35.89 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  34.39 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  35.1 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  32.11 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  33.99 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  33.78 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  33.06 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  35.2 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  32.82 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  33.07 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  32.82 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  33.07 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  34.43 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  33.33 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  34.88 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  37.7 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  37.17 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  32.43 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  33.46 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  32.38 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  32.05 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  35.1 
 
 		 310 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  35.85 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  37.17 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  31.28 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  36.27 
 
 		 189 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  35.23 
 
 		 205 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  37.17 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  37.17 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  37.17 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  35.6 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  34.85 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  34.8 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  34.8 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  34.8 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  31.02 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  37.1 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  36.56 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  35.9 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  37.1 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  35.9 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  30.61 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  36.04 
 
 		 189 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  34.87 
 
 		 189 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  35.53 
 
 		 189 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  30.7 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  31.12 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  31.13 
 
 		 304 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  29.57 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  29 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  34.76 
 
 		 190 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  28.5 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  28.5 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  31.55 
 
 		 190 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  34.59 
 
 		 193 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  29.17 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  33.87 
 
 		 203 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  27.45 
 
 		 231 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  29.69 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>