106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3979 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3979  catalase  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  86.13 
 
 		 274 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  83.81 
 
 		 275 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  78.47 
 
 		 297 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  62.32 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  63.73 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  62.32 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  61.62 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  58.6 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  59.29 
 
 		 287 aa  331  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  58.03 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  57.66 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  56.32 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  57.49 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  48.06 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  46.45 
 
 		 316 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  50.41 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  44.78 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  46.99 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  46.18 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  40.67 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  36.74 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  32.8 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  36.54 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  36.54 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  36.06 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  36.06 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  36.06 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  36.06 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  35.39 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  34.69 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  34.41 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  31.11 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  34.71 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  32.23 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  32.03 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  31.87 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  34.17 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  30.34 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  31.84 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  32.24 
 
 		 290 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  31.84 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  34.68 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  34.68 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  34.68 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  34.57 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  32.78 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  32.24 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  32.78 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  32.78 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  30.71 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  32.37 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  36.42 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  31.15 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  31.15 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  31.15 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  32.37 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  31.09 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  30.15 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  34.54 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  29.96 
 
 		 421 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  31.5 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  33.01 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  31.58 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  31.28 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  33.01 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  30.43 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  34.03 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  29.41 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  28.4 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  33.67 
 
 		 189 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  31.65 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  33.66 
 
 		 189 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  28.07 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  29.35 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  27.72 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  31.22 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  33 
 
 		 189 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  31.53 
 
 		 189 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  30.61 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  31.96 
 
 		 189 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  32.02 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  29.34 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  31.96 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  29.12 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  28.06 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  29.38 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  30.77 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  27.32 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  26.8 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  26.8 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  31.72 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  28.57 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>