25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1478 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
314 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  57.55 
 
 
281 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  56.79 
 
 
281 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  60.14 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  59.42 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  56.88 
 
 
301 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  42.44 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  29.04 
 
 
276 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
281 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  28.31 
 
 
329 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  28.4 
 
 
331 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
270 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  27.46 
 
 
276 aa  92.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  27.24 
 
 
280 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  29.22 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  28.79 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  25.26 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
473 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
2701 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  23.01 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.79 
 
 
616 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>