23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1238 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  45.82 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  45.29 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  44.53 
 
 		 301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  43.8 
 
 		 306 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  43.64 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  43.01 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  29.64 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  28.08 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  29.8 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  26.97 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  25.08 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  30.27 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  25.7 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  22.8 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 605 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  28.11 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1255  metallophosphoesterase  38 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  25 
 
 		 265 aa  42  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>