22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0024 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  49.45 
 
 
281 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  44.71 
 
 
276 aa  228  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  43.93 
 
 
278 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  42 
 
 
280 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  39.31 
 
 
267 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  37.93 
 
 
270 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
281 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  31.6 
 
 
281 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  32.97 
 
 
191 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  30.53 
 
 
329 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  26.51 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  28.57 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  26.62 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>