25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0237 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  100 
 
 
267 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
270 aa  238  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  37.31 
 
 
281 aa  216  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  40.07 
 
 
276 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  36.3 
 
 
280 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  38.7 
 
 
276 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
301 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
306 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  27.24 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  28.25 
 
 
191 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  23.79 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  24.45 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  26.69 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
606 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  25.61 
 
 
259 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>