18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9280 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  100 
 
 
329 aa  689    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  31.53 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 
314 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  28.66 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  26.77 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
281 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  27.61 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  27.19 
 
 
301 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  30.53 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  25.31 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  24.68 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  24.77 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  24.36 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  24.61 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  34.23 
 
 
191 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>