22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5473 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5473  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.77016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3736  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  51.43 
 
 		 163 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3583  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  28.57 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0104  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  33.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.96978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0654  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  35.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0224  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  30.43 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0179  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.38 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.416833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0178  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32.98 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166725  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1157  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  32 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2035  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.5 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2770  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2818  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  32 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0414  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  34.38 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0022  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  29.35 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00266512  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0053  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  33.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0172  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.91 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.169374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0112  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  29.47 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0120  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  31.91 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0402  sigma-54 modulation protein  27.72 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2827  SSU ribosomal protein S30P  30.53 
 
 		 193 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151976  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2604  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.53 
 
 		 192 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1149  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.17 
 
 		 195 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.870513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>