25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2590 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  87.91 
 
 
1113 bp  821    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  86.16 
 
 
1182 bp  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  86.54 
 
 
1113 bp  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  86.54 
 
 
1113 bp  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  86.42 
 
 
1113 bp  704    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  86.41 
 
 
1113 bp  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  86.29 
 
 
1182 bp  696    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  98.42 
 
 
936 bp  1409    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  87.04 
 
 
1113 bp  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  89.15 
 
 
1113 bp  900    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  85.91 
 
 
903 bp  672    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  90.22 
 
 
1113 bp  914    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  86.42 
 
 
1113 bp  704    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2590    100 
 
 
2576 bp  5107    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381059  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1656  transposase  96.82 
 
 
159 bp  272  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  100 
 
 
1248 bp  242  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0856    83.73 
 
 
904 bp  204  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785053  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  83.51 
 
 
915 bp  192  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  84.9 
 
 
1185 bp  172  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2390    81.15 
 
 
590 bp  119  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421324  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2532  hypothetical protein  95.71 
 
 
189 bp  115  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000219461  normal  0.306299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0912    83.51 
 
 
246 bp  65.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291215  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2836  transposase  87.04 
 
 
201 bp  52  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0267237  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1254    87.04 
 
 
572 bp  52  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0650    100 
 
 
957 bp  52  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.832413 
 
 
-
 
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