22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0856 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  87.92 
 
 		 1185 bp  862    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  91.84 
 
 		 915 bp  1154    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0856    100 
 
 		 904 bp  1792    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2390    87.97 
 
 		 590 bp  549  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421324  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  84.38 
 
 		 1113 bp  272  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  84.38 
 
 		 1113 bp  272  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  83.84 
 
 		 1113 bp  256  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  83.84 
 
 		 1113 bp  256  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0912    88.19 
 
 		 246 bp  248  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1254    89 
 
 		 572 bp  222  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  83 
 
 		 1113 bp  220  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  83.73 
 
 		 936 bp  204  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2590    83.73 
 
 		 2576 bp  204  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381059  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  82.42 
 
 		 1182 bp  204  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  82.13 
 
 		 1113 bp  196  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  82.13 
 
 		 1113 bp  196  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  81.84 
 
 		 903 bp  188  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  81.84 
 
 		 1113 bp  188  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  81.84 
 
 		 1182 bp  188  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  81.56 
 
 		 1113 bp  180  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2135    86.49 
 
 		 123 bp  101  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00416106  normal  0.0877451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  82.47 
 
 		 1119 bp  58  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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