21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2390 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2390    100 
 
 
590 bp  1170    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421324  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  90.45 
 
 
1185 bp  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  89.62 
 
 
915 bp  595  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0856    87.97 
 
 
904 bp  549  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785053  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0912    96.35 
 
 
246 bp  232  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291215  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  84.7 
 
 
1113 bp  141  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  84.7 
 
 
1113 bp  141  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  84.7 
 
 
1113 bp  141  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  78.59 
 
 
1113 bp  133  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  85.53 
 
 
1113 bp  127  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  83.61 
 
 
1182 bp  125  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  80.75 
 
 
1113 bp  121  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  81.15 
 
 
936 bp  119  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2590    81.15 
 
 
2576 bp  119  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381059  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  83.06 
 
 
903 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  80.38 
 
 
1113 bp  113  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  82.51 
 
 
1113 bp  109  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  82.51 
 
 
1182 bp  109  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  80 
 
 
1113 bp  105  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1254    87.88 
 
 
572 bp  101  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2135    90 
 
 
123 bp  87.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00416106  normal  0.0877451 
 
 
-
 
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