23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1254 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1254    100 
 
 		 572 bp  1134    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  96.05 
 
 		 1185 bp  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2836  transposase  97 
 
 		 201 bp  349  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0267237  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0912    91 
 
 		 246 bp  254  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  89.39 
 
 		 915 bp  226  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0856    89 
 
 		 904 bp  222  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2390    87.88 
 
 		 590 bp  101  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421324  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  87.8 
 
 		 1113 bp  83.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  87.8 
 
 		 1113 bp  83.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  87.8 
 
 		 1113 bp  83.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  87.5 
 
 		 1113 bp  79.8  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  87.67 
 
 		 936 bp  73.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  83.51 
 
 		 1119 bp  65.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1656  transposase  88.68 
 
 		 159 bp  58  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  88.68 
 
 		 1113 bp  58  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  85.29 
 
 		 1113 bp  56  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2590    87.04 
 
 		 2576 bp  52  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381059  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  87.04 
 
 		 1113 bp  52  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  86.79 
 
 		 903 bp  50.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  86.79 
 
 		 1113 bp  50.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  86.79 
 
 		 1113 bp  50.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  86.79 
 
 		 1182 bp  50.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  86.79 
 
 		 1182 bp  50.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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