33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1873 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1873  30S ribosomal protein S15P  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2345  30S ribosomal protein S15P  71.05 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000536573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2511  30S ribosomal protein S15P  58.55 
 
 		 152 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0606  30S ribosomal protein S15P  56 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0430  30S ribosomal protein S15P  56.58 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.515043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2661  30S ribosomal protein S15P  57.24 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000175245  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2235  30S ribosomal protein S15P  55.26 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0290  30S ribosomal protein S15P  52.63 
 
 		 152 aa  173  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0891  30S ribosomal protein S15P  51.33 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1830  30S ribosomal protein S15P  52.67 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1091  30S ribosomal protein S15P  52 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.958151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0826  30S ribosomal protein S15P  50.67 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.468442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1376  Ribosomal S13S15 domain protein  48 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0120  30S ribosomal protein S15P  47.9 
 
 		 170 aa  153  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.081747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0515  30S ribosomal protein S15P  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1401  Ribosomal S13S15 domain protein  46.75 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2402  Ribosomal S13S15 domain protein  47.33 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2134  Ribosomal S13S15 domain protein  45.45 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1173  30S ribosomal protein S15P  45.83 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0725  30S ribosomal protein S15P  46.26 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1972  30S ribosomal protein S15P  44.44 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0780  30S ribosomal protein S15P  44.44 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0774456  normal  0.0146525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2247  30S ribosomal protein S15P  44.37 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259397  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0598  30S ribosomal protein S15P  43.97 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06679  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s13 (Broad)  44.37 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.483621 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47482  predicted protein  42.67 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.202257 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9199  predicted protein  40.4 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.646638  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0615  30S ribosomal protein S15P  42.38 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0859  30S ribosomal protein S15P  47.29 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.844036 
 
 
-
 
NC_006686  CND02790  conserved hypothetical protein  41.72 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1386  Ribosomal S13S15 domain protein  44.3 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.624256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1508  30S ribosomal protein S15P  39.86 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0335292 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40147  Ribosomal protein S13, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.41 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>