33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0615 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0615  30S ribosomal protein S15P  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1401  Ribosomal S13S15 domain protein  74.51 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2402  Ribosomal S13S15 domain protein  72.37 
 
 		 156 aa  234  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2134  Ribosomal S13S15 domain protein  74.17 
 
 		 154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0725  30S ribosomal protein S15P  72.19 
 
 		 151 aa  230  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0430  30S ribosomal protein S15P  50.99 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.515043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2345  30S ribosomal protein S15P  47.68 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000536573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2235  30S ribosomal protein S15P  49.01 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2511  30S ribosomal protein S15P  48.34 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2661  30S ribosomal protein S15P  48.34 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000175245  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0606  30S ribosomal protein S15P  44.08 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0290  30S ribosomal protein S15P  45.7 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1873  30S ribosomal protein S15P  42.38 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1830  30S ribosomal protein S15P  42.76 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1091  30S ribosomal protein S15P  42.76 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.958151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0826  30S ribosomal protein S15P  42.76 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.468442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0891  30S ribosomal protein S15P  41.45 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0598  30S ribosomal protein S15P  45.14 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0780  30S ribosomal protein S15P  44.52 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0774456  normal  0.0146525 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1173  30S ribosomal protein S15P  43.84 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1972  30S ribosomal protein S15P  42.47 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0515  30S ribosomal protein S15P  42.86 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1376  Ribosomal S13S15 domain protein  40.4 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0859  30S ribosomal protein S15P  43.8 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.844036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1508  30S ribosomal protein S15P  41.98 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0335292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0120  30S ribosomal protein S15P  40.82 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.081747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2247  30S ribosomal protein S15P  40.13 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259397  normal  0.0148068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1386  Ribosomal S13S15 domain protein  42.66 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.624256  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9199  predicted protein  35.53 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.646638  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02790  conserved hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40147  Ribosomal protein S13, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  34.44 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47482  predicted protein  36.64 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.202257 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06679  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s13 (Broad)  34.35 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.483621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>