34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1401 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1401  Ribosomal S13S15 domain protein  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2402  Ribosomal S13S15 domain protein  83.87 
 
 		 156 aa  273  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2134  Ribosomal S13S15 domain protein  76.62 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0725  30S ribosomal protein S15P  80.13 
 
 		 151 aa  250  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0615  30S ribosomal protein S15P  74.51 
 
 		 153 aa  244  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0430  30S ribosomal protein S15P  52.6 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.515043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2345  30S ribosomal protein S15P  49.35 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000536573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1873  30S ribosomal protein S15P  46.75 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0606  30S ribosomal protein S15P  43.87 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0826  30S ribosomal protein S15P  46.45 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.468442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0290  30S ribosomal protein S15P  48.39 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2661  30S ribosomal protein S15P  50.32 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000175245  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2511  30S ribosomal protein S15P  49.36 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1830  30S ribosomal protein S15P  45.81 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1091  30S ribosomal protein S15P  45.81 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.958151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0891  30S ribosomal protein S15P  43.87 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2235  30S ribosomal protein S15P  48.39 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0598  30S ribosomal protein S15P  47.48 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1376  Ribosomal S13S15 domain protein  42.86 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0780  30S ribosomal protein S15P  43.15 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0774456  normal  0.0146525 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0515  30S ribosomal protein S15P  43.57 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1173  30S ribosomal protein S15P  41.78 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1972  30S ribosomal protein S15P  42.45 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0859  30S ribosomal protein S15P  44.53 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.844036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1508  30S ribosomal protein S15P  44.03 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0335292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0120  30S ribosomal protein S15P  43.33 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.081747  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47482  predicted protein  38.46 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.202257 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9199  predicted protein  38.93 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.646638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2247  30S ribosomal protein S15P  40.79 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259397  normal  0.0148068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1386  Ribosomal S13S15 domain protein  43.42 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.624256  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02790  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06679  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s13 (Broad)  36.91 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.483621 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40147  Ribosomal protein S13, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.71 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  35.62 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>