62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1229 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1229  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00281517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1616  hypothetical protein  50.78 
 
 
334 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
803 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  28.1 
 
 
232 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  25.64 
 
 
803 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  24.7 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  27.49 
 
 
221 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
812 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
819 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  35.64 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  30.58 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  37.66 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
816 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5249  PHP domain protein  28.18 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  27.15 
 
 
228 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
820 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
221 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  33.65 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.44 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  35.16 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  34.83 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  33.67 
 
 
280 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  26.98 
 
 
221 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  39.44 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  37.14 
 
 
286 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  40 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  37.33 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  32.95 
 
 
281 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  33.33 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  39.62 
 
 
774 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
810 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  37.33 
 
 
293 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  33.33 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  35.48 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  24.31 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  20.86 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  36.14 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  34.83 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  29.41 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  28.18 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
772 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  27.62 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
827 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  30.08 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  36.36 
 
 
773 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  28.39 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  32.26 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  32.58 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0915  PHP domain protein  31.25 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  32.04 
 
 
281 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  32.32 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  35.63 
 
 
296 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  34.67 
 
 
266 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  30.85 
 
 
486 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  34.78 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  32.29 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  24.65 
 
 
216 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  27.21 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  32.97 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  33.33 
 
 
777 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  34.57 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>