28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2488 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  50 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  41.46 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  43.9 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  39.08 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  37.93 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  40.51 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  39.24 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  45.68 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  39.24 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  40.26 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  45 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  39.24 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  39.24 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  38.96 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  39.24 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  35.37 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  38.96 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  35.06 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0437  hypothetical protein  37.1 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000124  hypothetical protein  29.21 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522867  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0495  hypothetical protein  33.73 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0124283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>