26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1509 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  97.83 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  93.68 
 
 
95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  92.63 
 
 
95 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  92.63 
 
 
95 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  95.65 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  95.65 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  95.65 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  95.65 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  81.25 
 
 
100 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  87.21 
 
 
89 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  89.29 
 
 
92 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  78.49 
 
 
114 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  82.22 
 
 
94 aa  151  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  90.12 
 
 
86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  82.56 
 
 
89 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  43.37 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  40.51 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  38.46 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  34.12 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  34.85 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  32.95 
 
 
94 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  27.38 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  29.89 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>