29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1973 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  57.14 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  50.55 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  47.78 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  46.97 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  38.82 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  35.96 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  34.12 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  34.12 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  34.12 
 
 		 100 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  35.87 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  34.62 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  32.56 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  31.4 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  39.39 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0495  hypothetical protein  43.1 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0124283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000124  hypothetical protein  36.92 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522867  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0437  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>