26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2661 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  172  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  92.59 
 
 
95 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  91.36 
 
 
95 aa  153  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  91.46 
 
 
92 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  90.24 
 
 
89 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  91.36 
 
 
96 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  91.36 
 
 
96 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  91.36 
 
 
96 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  90.12 
 
 
95 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  91.36 
 
 
96 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  90.12 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  90.12 
 
 
92 aa  151  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  85.88 
 
 
89 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  85.71 
 
 
94 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  81.71 
 
 
100 aa  143  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  79.07 
 
 
114 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  43.9 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  49.4 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  40 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  38.96 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  38.96 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  34.62 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  40.3 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  32.5 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>