26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2488 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  87.5 
 
 		 89 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  86.36 
 
 		 89 aa  156  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  83.7 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  89.29 
 
 		 92 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  89.29 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  89.29 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  89.29 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  89.29 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  89.29 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  82.61 
 
 		 95 aa  154  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  89.16 
 
 		 94 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  91.46 
 
 		 86 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  81.52 
 
 		 95 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  83.33 
 
 		 100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  73.91 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  44.16 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  46.25 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  40.26 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  40.26 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  37.8 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  32.56 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  37.14 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  31.71 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  32.93 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  29.49 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>