26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2730 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2730  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0132668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1647  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1613  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1624  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1509  hypothetical protein  95.65 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1814  hypothetical protein  93.48 
 
 
92 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2635  hypothetical protein  93.41 
 
 
95 aa  175  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2475  hypothetical protein  94.51 
 
 
95 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2543  hypothetical protein  93.41 
 
 
95 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  82.8 
 
 
100 aa  157  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1562  hypothetical protein  88.37 
 
 
89 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.492811  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2488  hypothetical protein  89.29 
 
 
92 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.486773  normal  0.0137483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2433  hypothetical protein  79.12 
 
 
114 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  84.44 
 
 
94 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  83.72 
 
 
89 aa  151  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2661  hypothetical protein  91.36 
 
 
86 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  40.51 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  38.75 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  38.04 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  35.29 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  36.71 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1552  hypothetical protein  34.41 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  38.57 
 
 
91 aa  47.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  27.71 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  29.89 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>