15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000124 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000124  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522867  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05731  hypothetical protein  83.61 
 
 		 150 aa  219  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0495  hypothetical protein  66.1 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0437  hypothetical protein  39.82 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3759  hypothetical protein  37.21 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02823  putative orphan protein  31.03 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0332128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2994  hypothetical protein  32.22 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00215548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1470  peptidase, metallopeptidases  34.48 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1973  putative orphan protein  36.92 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000168926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3090  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2016  hypothetical protein  36.25 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2488  hypothetical protein  29.21 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2635  hypothetical protein  30.95 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0437  hypothetical protein  40.98 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00329875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>