33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0645 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0645  tRNA-Sec  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt029  tRNA-Sec  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0658058  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0129  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121569  hitchhiker  0.00785763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0135  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0033  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0301909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0110  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>