More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03234 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03234  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000275894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  60.34 
 
 
201 aa  147  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  59.32 
 
 
202 aa  141  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  54.7 
 
 
209 aa  140  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  57.26 
 
 
205 aa  140  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  57.76 
 
 
201 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  58.47 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  58.47 
 
 
204 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  56.41 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  53.45 
 
 
201 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  56.03 
 
 
201 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  53.85 
 
 
205 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  56.03 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  51.64 
 
 
204 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  55.17 
 
 
205 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  55.17 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  54.31 
 
 
205 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  54.31 
 
 
205 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  54.7 
 
 
203 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  54.7 
 
 
206 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  54.31 
 
 
208 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  54.7 
 
 
203 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  54.7 
 
 
215 aa  130  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  53.45 
 
 
205 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  53.45 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  50.86 
 
 
206 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  50.86 
 
 
206 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  50.86 
 
 
206 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  51.28 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  51.28 
 
 
207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  53.45 
 
 
208 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  50.43 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  50.43 
 
 
208 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
203 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  46.88 
 
 
207 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  50.43 
 
 
207 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
207 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
207 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  50.45 
 
 
202 aa  120  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
203 aa  120  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 
208 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
206 aa  119  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
206 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
206 aa  119  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
206 aa  119  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2633  dephospho-CoA kinase (dephosphocoenzyme a kinase)  57.26 
 
 
207 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  51.3 
 
 
203 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0066  dephospho-CoA kinase  49.57 
 
 
230 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000029391  normal  0.557904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2684  dephospho-CoA kinase  50.86 
 
 
205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00367316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
207 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
207 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0061  dephospho-CoA kinase  48.7 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000202187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3341  dephospho-CoA kinase  52.83 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0282  dephospho-CoA kinase  47.5 
 
 
196 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  45.69 
 
 
198 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  42.62 
 
 
207 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  44.92 
 
 
216 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  46.15 
 
 
306 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  41.73 
 
 
204 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  42.98 
 
 
212 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  39.82 
 
 
199 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  39.82 
 
 
199 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04889  dephospho-CoA kinase  45.22 
 
 
202 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  41.8 
 
 
202 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  40.98 
 
 
202 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  44.26 
 
 
202 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  36.28 
 
 
201 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  46.55 
 
 
206 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2501  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
195 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 
197 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  45.53 
 
 
210 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  47.01 
 
 
201 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  42.62 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  43.33 
 
 
215 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  45.3 
 
 
200 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  36.28 
 
 
201 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3605  dephospho-CoA kinase  42.74 
 
 
195 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.934183  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  41.8 
 
 
202 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  41.8 
 
 
202 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 
208 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2971  Dephospho-CoA kinase  46.96 
 
 
202 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  38.84 
 
 
202 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  40.98 
 
 
202 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  46.15 
 
 
392 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  42.86 
 
 
410 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  40.98 
 
 
200 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3459  dephospho-CoA kinase  44.35 
 
 
201 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  40 
 
 
199 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>