72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1596 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1596  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0152  transposase  93.85 
 
 
185 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  43.64 
 
 
411 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.93 
 
 
391 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.93 
 
 
391 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.93 
 
 
391 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2348  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2117  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1934  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1914  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0701  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000557793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0668  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1900  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000444676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1221  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.907366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0925  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.376661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0686  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0878999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0653  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0944  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0209706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1948  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0174074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2155  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00999257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2391  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0623667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.23 
 
 
396 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0763  hypothetical protein  39.22 
 
 
288 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.250841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44 
 
 
396 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44 
 
 
396 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44 
 
 
396 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44 
 
 
396 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44 
 
 
396 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1595  transposase  43.64 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  37.25 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0196  hypothetical protein  27.91 
 
 
277 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1410  transposase  32.73 
 
 
394 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00377453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0786  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 
322 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1044  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.343683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0153  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1916  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1724  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1357  IS30 family transposase  54.29 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.14 
 
 
408 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  29.87 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  29.87 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  29.87 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.82 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  40.82 
 
 
442 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1003  hypothetical protein  54.29 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  40.82 
 
 
418 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  40.82 
 
 
418 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  37.25 
 
 
418 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0015  transposase  38.78 
 
 
299 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.3 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  40.82 
 
 
418 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  40.82 
 
 
418 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>