19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1621 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1952  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0891  hypothetical protein  45.83 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0392  hypothetical protein  48.37 
 
 		 183 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1725  hypothetical protein  46.99 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.952025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1457  hypothetical protein  44.12 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.997202  normal  0.052641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0598  hypothetical protein  44.12 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.302437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0408  hypothetical protein  42.05 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1202  hypothetical protein  39.27 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.696548  normal  0.814193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0528  hypothetical protein  42.69 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000041727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2264  hypothetical protein  44.91 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0101423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0118  hypothetical protein  42.35 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1376  hypothetical protein  40.79 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.371971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2660  hypothetical protein  43.57 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2571  hypothetical protein  38.96 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137403  hitchhiker  0.000420654 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1462  hypothetical protein  36.75 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1436  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0701  hypothetical protein  31.52 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0667  hypothetical protein  25.68 
 
 		 170 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>