18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2264 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2264  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  804    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0101423  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0598  hypothetical protein  47.67 
 
 
237 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.302437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1457  hypothetical protein  47.67 
 
 
274 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.997202  normal  0.052641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0408  hypothetical protein  47.09 
 
 
274 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0118  hypothetical protein  46.51 
 
 
274 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1202  hypothetical protein  46.75 
 
 
273 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.696548  normal  0.814193 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0891  hypothetical protein  42.26 
 
 
254 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1725  hypothetical protein  42.33 
 
 
188 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.952025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0392  hypothetical protein  47.65 
 
 
183 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1621  hypothetical protein  44.51 
 
 
285 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0528  hypothetical protein  42.6 
 
 
200 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000041727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1952  hypothetical protein  44.51 
 
 
223 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1376  hypothetical protein  43.54 
 
 
185 aa  126  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.371971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1462  hypothetical protein  36.36 
 
 
388 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2660  hypothetical protein  36.23 
 
 
190 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2571  hypothetical protein  34.62 
 
 
222 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137403  hitchhiker  0.000420654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1436  hypothetical protein  36.49 
 
 
256 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0701  hypothetical protein  33.68 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>