18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1436 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1436  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0891  hypothetical protein  33.55 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0118  hypothetical protein  30.04 
 
 
274 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1457  hypothetical protein  31.53 
 
 
274 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.997202  normal  0.052641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0408  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0598  hypothetical protein  31.84 
 
 
237 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.302437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1202  hypothetical protein  34.19 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.696548  normal  0.814193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1725  hypothetical protein  30.68 
 
 
188 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.952025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2571  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137403  hitchhiker  0.000420654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1621  hypothetical protein  35.43 
 
 
285 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2264  hypothetical protein  36.49 
 
 
385 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0101423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1952  hypothetical protein  35.43 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0528  hypothetical protein  32.5 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000041727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0392  hypothetical protein  30.56 
 
 
183 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1462  hypothetical protein  30.07 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1376  hypothetical protein  29.61 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.371971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2660  hypothetical protein  30.71 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0701  hypothetical protein  29.61 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>